Dr. Fabián Villena

Cirujano Dentista, Universidad Diego Portales, Santiago de Chile, 2017.
Magíster en Ciencias, mención Informática Médica, Universidad de Chile, Santiago de Chile, 2020.
Candidato a Doctor en Ciencias de la Computación, Universidad de Chile, Santiago de Chile.

Cargo

PROFESOR ASISTENTE

Contacto

fabian.villena@uc.cl

Área de investigación::

Ciencia de datos, inteligencia artificial y procesamiento de lenguaje natural clínico

Mi investigación se centra en el desarrollo, evaluación e implementación de métodos de procesamiento de lenguaje natural, aprendizaje automático e inteligencia artificial aplicados a salud, con énfasis en datos clínicos en español y en escenarios donde la disponibilidad de datos es limitada. Dado que una parte importante de la información sanitaria se encuentra en textos clínicos no estructurados, mi trabajo busca transformar estos datos en herramientas útiles para la toma de decisiones clínicas, la gestión sanitaria y la investigación biomédica.

En particular, me enfoco en el diseño de modelos computacionales capaces de extraer, normalizar, clasificar y representar información clínica desde texto libre, con aplicaciones en listas de espera, codificación automática, apoyo al diagnóstico, priorización de pacientes, salud digital y odontología. Esta línea de investigación integra técnicas de ciencia de datos, modelos de lenguaje, aprendizaje profundo y evaluación de sistemas de inteligencia artificial en contextos clínicos reales.

Un objetivo central de mi trabajo es desarrollar soluciones robustas, reproducibles y transferibles al sistema de salud, considerando los desafíos propios de los datos clínicos, tales como privacidad, confidencialidad, sesgos, interoperabilidad, calidad de la información y seguridad de los pacientes. Asimismo, busco contribuir a la creación de recursos lingüísticos y metodológicos para el español clínico, promoviendo el uso responsable de inteligencia artificial en salud. A partir de estas bases, mi investigación apunta a generar herramientas que apoyen tanto la práctica clínica como la gestión sanitaria, con especial interés en su aplicación en odontología, salud pública y sistemas de salud latinoamericanos.

Publicaciones (últimos 5 años):

Villena, F., Bravo-Marquez, F., & Dunstan, J. (2026). Clinical-ShiftEval: A framework for simulating and evaluating model adaptation in dynamic clinical NLP tasks. BMC Medical Informatics and Decision Making. [IF: 3.8]
Villena, F., Báez, P., Peñafiel, S., Rojas, M., Paredes, I., & Dunstan, J. (2025). Developing and validating an automatic support system for tumor coding in pathology reports in Spanish. JCO Clinical Cancer Informatics. [IF: 2.8]
Villena, F., Bravo-Marquez, F., & Dunstan, J. (2025). NLP modeling recommendations for restricted data availability in clinical settings. BMC Medical Informatics and Decision Making, 25, 116. [IF: 3.8]
Dunstan, J., Vakili, T., Miranda, L., Villena, F., Aracena, C., Quiroga, T., Vera, P., Viteri Valenzuela, S., & Rocco, V. (2024). A pseudonymized corpus of occupational health narratives for clinical entity recognition in Spanish. BMC Medical Informatics and Decision Making, 24. [IF: 3.8]
Dunstan, J., Villena, F., Hoyos, J. P., Riquelme, V., Royer, M., Ramírez, H., & Peypouquet, J. (2023). Predicting no-show appointments in a pediatric hospital in Chile using machine learning. Health Care Management Science, 1–17. [IF: 2.0]
Chiu, C., Villena, F., Martin, K., Núñez, F., Besa, C., & Dunstan, J. (2022). Training and intrinsic evaluation of lightweight word embeddings for the clinical domain in Spanish. Frontiers in Artificial Intelligence, 5. [IF: 4.7]
Aracena, C., Villena, F., Arias, F., & Dunstan, J. (2022). Aplicaciones de aprendizaje automático en salud. Revista Médica Clínica Las Condes, 33, 568–575. [IF: 0.4]
Villena, F., Pérez, J., Lagos, R., & Dunstan, J. (2021). Supporting the classification of patients in public hospitals in Chile by designing, deploying and validating a system based on natural language processing. BMC Medical Informatics and Decision Making, 21, 1–11. [IF: 3.8]
Lecaros, C., Dunstan, J., Villena, F., Ashcroft, D., Parisi, R., Griffiths, C., Hartel, S., Maul, J., & De la Cruz, C. (2021). The incidence of psoriasis in Chile: An analysis of the national Waiting List Repository. Clinical and Experimental Dermatology. [IF: 2.8]
Báez, P., Villena, F., Zúñiga, K., Jones, N., Fernández, G., Durán, M., & Dunstan, J. (2021). Construction of text resources for automatic identification of clinical information in unstructured narratives. Revista Médica de Chile, 149, 1014–1022. [IF: 0.3]

Proyectos de investigación (últimos 10 años):

2026. Asociación Chilena de Seguridad. Proyecto: Generación de un modelo para salud ocupacional que realice transcripción de voz del español de Chile usando métodos computacionales y lingüísticos.
2024. NAACL Regional Americas Fund. Proyecto: Clinical NLP Winter School.
2024. Catalyst Project. Proyecto: Adoption of open science principles in under-served biomedical research communities.
2023. Asociación Chilena de Seguridad. Proyecto: Análisis masivo de textos clínicos para la construcción de herramientas de lenguaje en salud.

Escuela

Escuela

Pregrado

Pregrado

Postgrado

Postgrado

Educación Continua

Educación Continua

Clínica Docente

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Investigación

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Vínculos con la Sociedad

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International

International

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